Cet établissement scolaire doit son nom au grand résistant casamançais originaire de Séléki, tué par l’armée coloniale le 17 mai 1906.
Crée en 1957 pour abriter un cours normal, l’établissement est devenu d’enseignement général par la suite, et puis finalement seulement un lycée de second cycle.
Le dernier proviseur français du lycée Djignabo de Ziguinchor a été Christian Roche. Ce dernier a écrit une thèse de doctorat sur l’histoire de la Casamance entre 1850 et 1920.
Le premier proviseur sénégalais se nomme Fadel Dia, écrivain auteur de nombreuses publications.
Pendant longtemps seul établissement public secondaire en Casamance, aujourd’hui c’est un des plus grands lycées du Sénégal.
